生物工程系是我院擁有四十多年辦學(xué)歷史的傳統(tǒng)骨干系，也是學(xué)院重點(diǎn)建設(shè)和開發(fā)的教學(xué)部門，該系是全國食品藥品職業(yè)教學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)、全國食品職業(yè)教學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)委員所在單位；是國家職業(yè)資格證書培訓(xùn)基地，承擔(dān)公共營養(yǎng)師（高級）、食品檢驗(yàn)工（高級）、內(nèi)審員等培訓(xùn)和鑒定工作；擁有省級教學(xué)團(tuán)隊(duì)一支，即食品營養(yǎng)與檢測專業(yè)教學(xué)團(tuán)隊(duì)；現(xiàn)有食品營養(yǎng)與檢測、食品質(zhì)量與安全監(jiān)管、藥品質(zhì)量檢測技術(shù)、生物制藥技術(shù)四個(gè)專業(yè)，其中食品營養(yǎng)與檢測、食品質(zhì)量與安全監(jiān)管是省級重點(diǎn)專業(yè)，食品營養(yǎng)與檢測及食品加工類專業(yè)群為學(xué)校骨干校建設(shè)重點(diǎn)建設(shè)專業(yè)群。
生物工程系現(xiàn)有專任教師19名，其中教授5人，副教授6人，工程師2人，專任教師中57%為高級職稱、95%為雙師型教師，已形成師資力量雄厚、雙師結(jié)構(gòu)合理的高水平的專業(yè)教學(xué)團(tuán)隊(duì)。
生物工程系現(xiàn)有漢斯啤酒釀造基地、固體制劑、液體制劑、生物制藥工藝、包裝間、燈檢室、精密儀器分析、食品理化分析、微生物檢驗(yàn)等16個(gè)設(shè)備先進(jìn)、功能齊全的校內(nèi)實(shí)訓(xùn)室，引進(jìn)食品企業(yè)即三錦食品有限責(zé)任公司1個(gè)，各專業(yè)均與知名企業(yè)簽訂了訂單培養(yǎng)模式，學(xué)生在入學(xué)的第二年就能到企業(yè)帶薪頂崗實(shí)踐，實(shí)現(xiàn)強(qiáng)化專業(yè)技能、提高就業(yè)競爭力的目標(biāo)，畢業(yè)生就業(yè)率98%。
