生物工程系于2009年三院校整合中開始籌備，于2011年成立。
建系以來，逐步培養(yǎng)了一支學(xué)歷層次較高、專業(yè)技能全面、團(tuán)結(jié)協(xié)作的師資隊伍。現(xiàn)有專任教師36人，其中：蘭州市領(lǐng)軍人才1人；教授1人，副教授6人；博士3人，碩士22人。聘請行業(yè)企業(yè)兼職教師22人，其中客座教授4人。
建系之初，著眼于國家產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整，緊貼市場對實用型技能人才的需求，現(xiàn)已建成“農(nóng)業(yè)環(huán)境保護(hù)技術(shù)”、“園林技術(shù)”、 “生物制藥技術(shù)”、“微生物技術(shù)及應(yīng)用”和“烹飪工藝與營養(yǎng)” 五大專業(yè)，正在籌建“食品營養(yǎng)與檢測技術(shù)”新專業(yè)。其中“農(nóng)業(yè)環(huán)境保護(hù)技術(shù)”專業(yè)2011年被教育部、財政部確立為人才緊缺型專業(yè)，中央財政支持經(jīng)費150萬元，已建成首批國家級專業(yè)服務(wù)產(chǎn)業(yè)的示范專業(yè)。
現(xiàn)已建成藥物制劑實驗室、理化檢測實驗室、微生物實驗室、菌種實驗室、組培實驗室、發(fā)酵實驗室等12個實驗室，建成食用菌實訓(xùn)基地、園林園藝日光溫室、育種育苗實訓(xùn)室、啤酒和果酒生產(chǎn)性實訓(xùn)基地。
先后與廣東海納川藥業(yè)、天源黑馬藥業(yè)、海正藥業(yè)、旺旺集團(tuán)、中牧集團(tuán)、齊魯制藥等26家企業(yè)建立了校企合作關(guān)系，分別開展了學(xué)生實習(xí)和就業(yè)、共建實驗室、合作研發(fā)科研項目、捐資助學(xué)、合辦訂單班等合作內(nèi)容，先后辦成22個訂單班。與中科院蘭州近物所天然藥物中心、中國農(nóng)科院蘭州牧藥所藥物室、甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院、西藏農(nóng)牧科學(xué)院等科研院所建立了“?？坪献?rdquo;關(guān)系，共同進(jìn)行項目研發(fā)和技能人才培訓(xùn)。
教學(xué)科研成果與日俱增，其中：教學(xué)成果人才培養(yǎng)模式改革2011年獲甘肅省教學(xué)成果“教育廳級獎”；5項科技成果經(jīng)省級鑒定為國內(nèi)領(lǐng)先水平；“威力康的研制及產(chǎn)業(yè)化”2013年獲蘭州市科技進(jìn)步獎；申請各類科研項目12項，獲得經(jīng)費支持80多萬元；發(fā)表省級以上論文60余篇，其中SCI論文5篇，EI論文2篇，中文核心論文30余篇；編寫教材11部，申請專利10余項。
生物工程系自籌備以來，共培養(yǎng)三屆畢業(yè)生約300人。畢業(yè)生由于扎實的文化素養(yǎng)、全面的技能和實習(xí)期間的突出表現(xiàn)，深受企事業(yè)用人單位的歡迎，技能型人才供不應(yīng)求，就業(yè)率90%以上，其余學(xué)生畢業(yè)后分別考取了碩士研究生、2+2本科及甘肅省事業(yè)編制。
