化工学院基于1964年成立的化工系，1998年7月3日由化工与生化工程系、应用化学系和材料物理化学研究所合并成立化工学院，2000年9月8日原化工学院更名为材料科学与工程学院，2008年6月16日由化工与制药工程系、生物工程与技术系和环境科学与工程系成立新的化工学院。现下设化工与制药工程系、生物工程与技术系、环境科学与工程系和园艺系。
学院现有教职工86人，其中专任教师66人，实验室管理人员9人，行政管理人员11人。专任教师中，有教授19人，副教授23人，讲师24人；专任教师中有博士学位的有57人；学院拥有硕士生导师41人，博士生导师9人；在实验管理人员中有高级实验师2人。学院已初步形成了一支结构合理、教学经验丰富、有较强科研能力的教学科研队伍。
目前学院拥有一个国家一级博士授权点：化学工程与技术（含化学工程、化学工艺、生物化工、应用化学、工业催化5个二级博士点）；一级学科博士后流动站：化学工程与技术；化学工程与技术一级学科是福建省特色重点学科和福建省重点学科；一个国务院侨办重点学科：生物化工；九个二级硕士点：化学工程、化学工艺、生物化工、应用化学、工业催化、生物化学与分子生物学、微生物学、环境工程、环境科学；七个本科专业：化学工程与工艺、制药工程、生物工程、生物技术、园艺、环境工程、环境科学；两个工程硕士领域：化学工程、生物工程。三个硕士专业学位：化学工程、生物工程、环境工程。学院现有全日制各类学生1540人，其中本科生1360人，硕博士生172人。
近五年来，学院教师在认真完成教学任务的同时，先后承担了863计划项目子课题、国家海洋公益性行业科研专项子项目、国家自然科学基金项目等国家级项目30余项；高校博士点基金博导项目、福建省重大、重点、自然科学基金等省部级课题60余项；服务地方企事业合作横向课题50余项；厅级、校级及其它各类科研项目100余项；累计科研经费4000多万元；发表的论文被SCI、EI收录120余篇；申请中国发明专利获授权20余项。
在新的发展时期，学院将秉承和实践“科学、民主、拼搏、创新”的理念，励精图治，团结奋斗，不断提高教学、科研、管理水平和人才培养水平，实现“科学建院，民主治院，拼搏兴院，创新强院”，为国家的繁荣昌盛做出更大的贡献。
