承擔科研項目

　　主持“國家自然科學基金”、 “香江學者”人才基金、“中國博士后科學基金（一等資助）”和 “中央財政支持地方高校發(fā)展專項基金”等科研課題10余項。參與申請并獲得資助“國家自然科學基金”項目8項及“國家科技部‘863’項目”1項，獲資助金額500多萬元。作為科研骨干，參與“中國科學院知識創(chuàng)新重要方向項目”、 “中國科學院‘百人計劃’項目”、 “國家高技術研究發(fā)展規(guī)劃（863）項目”、“國家自然科學基金（含重大研究計劃、面上項目）”及“江蘇省自然科學基金”等課題多項。部分如下：

　　1、基于線粒體基因組全序列的唇口目苔蘚動物系統(tǒng)發(fā)育研究（40906067），國家自然科學基金，2010~2013

　　2、毛顎動物基因組進化標記基因的研究（2012M510054），中國博士后科學基金（一等資助），2012~2015

　　3、亞洲海水/淡水生物親緣地理學（XJ2012056），“香江學者”人才基金，2013~2015

　　4、非模式生物基因組遺傳變異的識別算法和進化基因組計算平臺的建立（91131013），國家自然科學基金（重大研究計劃），2013~2016

　　5、中國西施舌亞種的線粒體基因組證據(jù)（BK20131210），江蘇省自然科學基金，2014~2016

　　發(fā)表論文

　　近年來，在《BMC Genomics》、《Molecular Phylogenetics and Evolution》、《Molecular Biology and Evolution》、《Gene》、《Journal of Biogeography》、《Molecular Biology Reports》、《Science China》、《Marine Genomics》、《Genome》、《Comparative Biochemistry and Physiology Part D》、《Marine Drugs》、《Journal of Molecular Evolution》、《Mitochondrial DNA》、《Acta Oceanologica Sinica》、《中國科學》、《海洋學報》和《海洋與湖沼》等學術期刊上發(fā)表研究論文近100篇，其中SCI論文30余篇（總影響因子超過80）；參編專著2本。部分論文如下：

　　1、Shen X.（申欣）, Ren J., Cui Z., Sha Z., Wang B., Xiang J., Liu B.: The complete mitochondrial genomes of two common shrimps (Litopenaeus vannamei and Fenneropenaeus chinensis) and their phylogenomic considerations. Gene, 2007, 403(1-2):98-109. （SCI）

　　2、Shen X.（申欣）, Ma X., Ren J., Zhao F.: A close phylogenetic relationship between Sipuncula and Annelida evidenced from the complete mitochondrial genome sequence of Phascolosoma esculenta. BMC Genomics, 2009, 10: 136-146. （SCI）

　　3、Shen X.（申欣）, Tian M., Liu Z., Cheng H., Tan J., Meng X., Ren J.: Complete mitochondrial genome of the sea cucumber Apostichopus japonicus (Echinodermata: Holothuroidea): the first representative from the subclass Aspidochirotacea with the echinoderm ground pattern. Gene, 2009, 439 (1-2): 79-86.（SCI）

　　4、Shen X.（申欣）, Sun M., Wu Z., Tian M., Cheng H., Zhao F., Meng X.: The complete mitochondrial genome of the ridgetail white prawn Exopalaemon carinicauda Holthuis, 1950 (Crustacean: Decapoda: Palaemonidae) revealed a novel rearrangement of tRNA genes. Gene, 2009, 437 (1-2): 1-8.（SCI）

　　5、Shen X.（申欣）, Wang H., Ren J., Tian M., Wang M.: The mitochondrial genome of Euphausia superba (Prydz Bay) (Crustacea: Malacostraca: Euphausiacea) reveals a novel gene arrangement and potential molecular markers. Molecular Biology Reports, 2010, 37 (2): 771-784. （SCI）

　　6、Shen X.（申欣）, Wu Z., Sun M., Ren J., Liu B.: The complete mitochondrial genome sequence of Whitmania pigra (Annelida, Hirudinea): the first representative from the class Hirudinea. Comparative Biochemistry and Physiology Part D, 2011, 6 (2): 133-138.（SCI）

　　7、Shen X.（申欣）, Wang H., Wang M., Liu B.: The complete mitochondrial genome sequence of Euphausia pacifica (Malacostraca: Euphausiacea) reveals a novel gene order and unusual tandem repeats. Genome, 2011, 54 (11): 911-922.（SCI）

　　8、Shen X.（申欣）, Tian M., Meng X., Liu H., Cheng H., Zhu C., Zhao F.: Complete mitochondrial genome of Membranipora grandicella (Bryozoa: Cheilostomatida) determined with next-generation sequencing: the first representative of the suborder Malacostegina. Comparative Biochemistry and Physiology Part D, 2012, 7 (3): 248-253.（第一作者、通訊作者，SCI）

　　9、Shen X.（申欣）, Li X., Sha Z., Yan B., Xu Q.: Complete mitochondrial genome of the Japanese snapping shrimp Alpheus japonicus (Crustacea: Decapoda: Caridea): gene rearrangement and phylogeny within Caridea. Science China Life Sciences, 2012, 55 (7): 591-598.（SCI）

　　10、Shen X.（申欣）, Sun M., Tian M., Zhao F., Chu K.: The first mitochondrial genome from Mysida (Crustacea: Malacostraca) reveals an unusual gene arrangement. Mitochondrial DNA, 2014, doi: 10.3109/19401736.2013.823185. （SCI）

　　11、Shen X.（申欣）, Chan B., Tsang L.: The complete mitochondrial genome of common fouling barnacle Amphibalanus amphitrite (Darwin, 1854) (Sessilia: Balanidae) reveals gene rearrangements compared to pancrustacean ground pattern. Mitochondrial DNA, 2014, doi:10.3109/19401736.2013.855745. （SCI）

　　12、Shen X.（申欣）, Tian M., Yan B., Chu K.: Phylomitogenomics of Malacostraca (Arthropoda: Crustacea). Acta Oceanologica Sinica, 2014, in press（SCI）

　　13、Shen X.（申欣）, Chan B., Tsang L.: The mitochondrial genome of Nobia grandis Sowerby, 1839 (Cirripedia: Sessilia): The first report from the coral-inhabiting barnacles family Pyrgomatidae. Mitochondrial DNA, 2014, doi:10.3109/19401736.2014.892106. （SCI）

　　14、Shen X.（申欣）, Meng X., Chu K., Zhan N., Tian M., Liang M., Hao J.: Comparative mitogenomic analysis reveals cryptic species: A case study in Mactridae (Mollusca: Bivalvia). Comparative Biochemistry and Physiology Part D, 2014, 12: 1-9.（SCI）

　　15、Shen X.（申欣）, Chu K., Chan, B., Tsang, L.: The complete mitochondrial genome of the fire coral-inhabiting barnacle Megabalanus ajax (Sessilia: Balanidae): genes rearrangements and atypical gene content. Mitochondrial DNA, 2014, doi:10.3109/19401736.2014.936424. （SCI）

　　16、Sun M., Shen X.（申欣）*, Liu H., Liu X., Wu Z., Liu B.: Complete mitochondrial genome of Tubulipora flabellaris (Bryozoa: Stenolaemata): the first representative from the class Stenolaemata with unique gene order. Marine Genomics, 2011, 4 (3): 159-165.（*通訊作者，SCI）

　　17、Sun M., Wu Z., Shen X.（申欣）*, Ren J., Liu X., Liu H., Liu B.: The complete mitochondrial genome of Watersipora subtorquata (Bryozoa, Gymnolaemata, Ctenostomata) with phylogenetic consideration of Bryozoa. Gene, 2009, 439 (1-2): 17-24.（*通訊作者，SCI）

　　18、Wu Z.?, Shen X.（申欣）?, Sun M., Ren J., Wang Y., Huang Y., Liu B.: Phylogenetic analyses of complete mitochondrial genome of Urechis unicinctus (Echiura) support that echiurans are derived annelids. Molecular Phylogenetics and Evolution, 2009, 52 (2): 558-562.（?并列第一作者，SCI）

　　19、Ren J., Shen X.（申欣）, Sun M., Jiang F., Yu Y., Chi Z., Liu B.: The complete mitochondrial genome of the clam Meretrix petechialis (Mollusca: Bivalvia: Veneridae). Mitochondrial DNA, 2009, 20 (4): 78-87.（SCI）

　　20、Ren J., Shen X.（申欣）, Jiang F., Liu B.: The mitochondrial genomes of two scallops, Argopecten irradians and Chlamys farreri (Mollusca: Bivalvia): the most highly rearranged gene order in the family Pectinidae. Journal of Molecular Evolution, 2010, 70 (1): 57-68.（SCI）

　　21、Meng X., Zhao N., Shen X.（申欣）*, Hao J., Liang M., Zhu X., Cheng H., Yan B., Liu Z.: Complete mitochondrial genome of Coelomactra antiquata (Mollusca: Bivalvia): The first representative from the family Mactridae with novel gene order and unusual tandem repeats. Comparative Biochemistry and Physiology Part D, 2012, 7 (2): 175-179.（*通訊作者，SCI）

　　22、Meng X., Shen X.（申欣）*, Zhao N., Tian M., Liang M., Hao J., Cheng H., Yan B., Dong Z., Zhu X.: Mitogenomics reveals two subspecies in Coelomactra antiquata (Mollusca: Bivalvia). Mitochondrial DNA, 2012, 24(2):102-104.（*通訊作者，SCI）

　　23、Meng X., Shen X.（申欣）*, Zhao N., Tian M., Liang M., Hao J., Cheng H., Yan B., Dong Z., Zhu X.: The complete mitochondrial genome of the clam Mactra veneriformis (Bivalvia: Mactridae): Has a unique non-coding region, missing atp8 and typical tRNASer. Mitochondrial DNA, 2013, 24(6):613-615. （*通訊作者，SCI）

　　24、Jiang F., Miao Y., Liu B., Shen X.（申欣）, Ren J, He F.: Mitochondrial Introgressions into the Nuclear Genome of the Domestic Horse. Zoological Research, 2008, 29(6):577-584. （SCI）

　　25、Cheng H., Meng X., Sun S., Shi X., Peng Y., Dong Z., Shen X.（申欣）: Cloning and expression analysis of a cDNA encoding lipoprotein lipase from liver of adult grass carp (Ctenopharyngodon idella). Aquaculture Research, 2009, 40(16): 1838-1848. （SCI）

　　26、Cheng H., Sun S., Peng Y., Shi X., Shen X.（申欣）, Meng X., Dong Z.: cDNA sequence and tissues expression analysis of lipoprotein lipase from common carp (Cyprinus carpio Var. Jian). Molecular Biology Reports, 2010, 37(6):2665-2673. （SCI）

　　27、Cheng H., Ji N., Peng Y., Shen X.（申欣）, Xu J., Dong Z.: Molecular characterization and tissue-specific expression of the acetyl-CoA carboxylase alpha gene from Grass carp, Ctenopharyngodon idella. Gene, 2011, 487(1):46-51. （SCI）

　　28、Tsang L.?, Shen X.（申欣）?, Chu K., Chan B.: Complete mitochondrial genome of the acorn barnacle Striatobalanus amaryllis (Crustacea: Maxillopoda): The first representative from Archaeobalanidae. Mitochondrial DNA, 2014, doi:10.3109/19401736.2013.855739. （?并列第一作者，SCI）

　　29、Wang, M., Sun S., Li C., Shen X.（申欣）: Distinctive mitochondrial genome of Calanoid copepod Calanus sinicus with multiple large non-coding regions and reshuffled gene order: useful molecular markers for phylogenetic and population studies. BMC Genomics, 2011, 12: 73-92.（SCI）

　　30、Wang Z.?, Shen X.（申欣）?, Liu B., Su J., Yonezawa T., Yu Y., Guo S., Ho S.Y.W., Vilà C., Hasegawa M., Liu J.: Phylogeographical analyses of domestic and wild yaks based on mitochondrial DNA: new data and reappraisal. Journal of Biogeography, 2010, 37 (12): 2332-2344.（?并列第一作者，SCI）

　　31、Wang Z., Yonezawa T., Liu B., Ma T., Shen X.（申欣）, Su J., Guo S., Hasegawa M. and Liu J.: Domestication relaxed selective constraints on the yak mitochondrial genome. Molecular Biology and Evolution 2011, 28 (5): 1553-1556.（SCI）

　　32、Kenny N., Sin Y., Shen X.（申欣）, Zhe Q., Wang W., Chan T., Tobe S., Shimeld S., Chu K., Hui J.: Genomic sequence and experimental tractability of a new decapod shrimp model, Neocaridina denticulata. Marine Drugs, 2014, 12(3): 1419-1437.（SCI）

　　33、申欣, 孫松, 張光濤. 浮游生物光學計數(shù)器（OPC-1L）精度控制關鍵問題研究. 海洋與湖沼, 2008, 39(4): 341-347.

　　34、申欣, 孫松, 王海青, 王敏曉, 任建峰, 張光濤, 劉斌. 南極磷蝦(Euphausia superba)線粒體基因組特征及其分子標記應用. 海洋與湖沼, 2008, 39(5): 446-454.

　　35、申欣. 對蝦科線粒體基因組特征及基因差異位點分析. 水產科學, 2010, 29(12):711-717.

　　36、申欣, 吳志剛. 單環(huán)刺螠線粒體基因組全序列的獲得——長PCR結合鳥槍法測序. 海洋科學, 2010, 34(12):26-29.

　　37、申欣, 孫名安. 長臂蝦科線粒體基因組特征分析及分子標記探討. 水產科學, 2011, 30(6):347-351.

　　38、申欣, 田美, 孟學平, 程漢良. 10種軟骨魚線粒體基因組特征分析. 漁業(yè)科學進展, 2011, 32(3):26-32.

　　39、申欣, 田美, 程漢良, 孟學平, 任建峰. 海參綱線粒體基因組特征分析及分子標記探討. 水產科學, 2011, 30(7):400-404.

　　40、申欣, 田美, 孟學平, 程漢良. 文昌魚線粒體基因組特征分析及分子標記探討. 海洋科學, 2011, 35(7):7-13.

　　41、申欣, 王海青, 王敏曉, 劉斌. 磷蝦類線粒體基因組的特征和基因排列比較. 漁業(yè)科學進展, 2012, 33(2):49-55.

　　42、申欣, 田美, 孟學平, 程漢良, 彭永興, 李士虎. 鱘類線粒體基因組分子標記、遺傳距離及系統(tǒng)演化分析. 水產科學, 2012, 31(7):413-418.

　　43、申欣. 星蟲動物線粒體基因組全序列的基因排列和特征比較. 水產科學, 2012, 31(9):554-559.

　　44、申欣, 李曉, 徐啟華. 日本鼓蝦與鮮明鼓蝦線粒體基因組全序列的分析比較. 海洋學報, 2012, 34(5) :147-153.

　　45、申欣, 田美, 孟學平, 程漢良, 李士虎. 尾索動物線粒體基因組特征比較及分子系統(tǒng)發(fā)育. 海洋科學, 2012, 36(11):30-37.

　　46、申欣, 田美, 朱長保, 劉會蓮, 趙方慶. 應用新一代測序技術測定大室別藻苔蟲線粒體基因組全序列. 海洋學報, 2012, 34(2) :136-142.

　　47、申欣, 李曉, 沙忠利, 閻斌倫, 徐啟華. 日本鼓蝦線粒體基因組: 真蝦下目內部的基因重排與系統(tǒng)發(fā)育. 中國科學, 2012, 42(7): 595-602.

　　48、申欣, 田美, 孟學平, 程漢良, 閻斌倫. 棘皮動物線粒體基因組的基因重排、分子標記及系統(tǒng)發(fā)生分析. 海洋學報, 2013, 35 (5): 137-146.

　　49、申欣, 田美, 孟學平, 程漢良, 許建和, 閻斌倫. 鲆鰈類線粒體基因排列、特征比較及系統(tǒng)發(fā)生分析. 水產科學, 2013, 32 (10): 590-596.

　　50、申欣, 田美, 孟學平, 程漢良, 閻斌倫. 鰻鱺目魚類線粒體蛋白質編碼基因易位及系統(tǒng)演化關系分析. 海洋學報, 2014, 36 (4):73-81.

　　51、申欣, 田美, 孟學平, 程漢良, 閻斌倫.鰭足類線粒體基因的選擇壓力比較及進化關系探討. 海洋學報, 2014, 36 (6):87-93.

　　成果獲獎情況

　　1、江蘇省“青藍工程”人才培養(yǎng)對象，省級，2010

　　2、江蘇省“優(yōu)秀畢業(yè)設計（論文）指導教師獎”，省級，2011

　　3、遼寧省“水產學會優(yōu)秀論文”一等獎（通訊作者），省級，2012

　　4、“香江學者”獎（“海洋科學”學科首位入選者），國家級，2012

　　5、江蘇省“333高層次人才培養(yǎng)工程”中青年科學技術帶頭人，省級，2013

　　6、連云港市“521高層次人才培養(yǎng)工程” 學術技術帶頭人，市級，2014