近日，山西農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院朱迎春教授團(tuán)隊(duì)在《食品科學(xué)技術(shù)學(xué)報(bào)》發(fā)表了高水平論文：產(chǎn)脂肪酶木糖葡萄球菌YCC3全基因組測(cè)序及序列分析。
木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylosus,S.xylosus)YCC3是從發(fā)酵肉制品中分離篩選到的1株產(chǎn)脂肪酶活性高的菌株，為研究該菌株在香腸發(fā)酵過(guò)程中的代謝機(jī)理和功能，采用PromethION和Illumina HiSeq測(cè)序平臺(tái)對(duì)S.xylosus YCC3進(jìn)行圖測(cè)序分析。結(jié)果表明，S.xylosusYCC3基因組為1套含有3個(gè)質(zhì)粒的環(huán)狀分子，基因組序列總長(zhǎng)度為2 773 035 bp，GC含量(鳥(niǎo)嘌呤和胞嘧啶占基因組序列的比率)為32.88%?；蚪M中預(yù)測(cè)到2 540個(gè)編碼基因，編碼基因總長(zhǎng)度為 2 742 136 bp,平均長(zhǎng)度為1 079.58 bp，占基因組的83.24%。S.xylosusYCC3的編碼基因通過(guò)GO(Gene Ontology)數(shù)據(jù)庫(kù)注釋?zhuān)A(yù)測(cè)到與抗氧化活性相關(guān)的基因3個(gè)；COG(Cluster of Orthologous Groups of Proteins)數(shù)據(jù)庫(kù)注釋到與脂質(zhì)運(yùn)輸和代謝相關(guān)的基因中有8個(gè)含有脂肪酸合成基因、4個(gè)含有脂肪水解酶基因；KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)數(shù)據(jù)庫(kù)注釋到與脂肪酸合成相關(guān)的基因16個(gè)，與脂肪酸降解相關(guān)的基因10個(gè)，與不飽和脂肪酸合成相關(guān)的基因3個(gè)。S.xylosus菌株的基因組基本功能注釋和代謝通路基因信息注釋旨在為菌株S.xylosusYCC3作為發(fā)酵劑在香腸發(fā)酵中的應(yīng)用提供了理論依據(jù)。
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