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研究揭示雙加氧酶的低復(fù)雜度結(jié)構(gòu)域調(diào)控DNA氧化去甲基化

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2024-01-09  瀏覽次數(shù):1065
  1月4日,《自然-結(jié)構(gòu)與分子生物學(xué)》(Nature Structural&Molecular Biology)在線發(fā)表了中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心杜雅蕊/徐國良團隊完成的題為Auto-suppression of Tet dioxygenases protects the mouse oocyte genome from oxidative demethylation的研究成果。該研究揭示了Tet雙加氧酶催化活性中心的一個低復(fù)雜度結(jié)構(gòu)域(Low complexity domain,LCD)介導(dǎo)該家族蛋白的酶活負(fù)調(diào)控,闡述了LCD保護卵母細(xì)胞甲基化組免受過度氧化的重要作用,顯示DNA甲基化譜式的正常建立對于哺乳動物發(fā)育至關(guān)重要。
 
  以5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)為主的DNA甲基化是表觀遺傳調(diào)控的重要方式,在調(diào)控基因表達、建立基因印記、維持X染色體失活和轉(zhuǎn)座子沉默等生理過程中發(fā)揮重要作用。DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)和Tet雙加氧酶(Tet dioxygenases)共同調(diào)控DNA甲基化譜式的形成。Tet雙加氧酶介導(dǎo)的DNA氧化去甲基化的發(fā)現(xiàn)是近年來染色質(zhì)與細(xì)胞命運研究領(lǐng)域的重要進展。然而,迄今為止對于Tet蛋白的研究局限于基因敲除實驗??茖W(xué)家對Tet雙加氧酶對5mC的時空和基因組位點特異性氧化的機制缺乏了解。
 
  該研究發(fā)現(xiàn)LCD缺失的Tet3突變體的酶活顯著增強。不同于以往對于Tet蛋白的研究局限于功能喪失的方法,研究利用基于孤雄單倍體干細(xì)胞技術(shù)的基因編輯策略,構(gòu)建了酶活增強的小鼠模型,發(fā)現(xiàn)了卵子發(fā)生過程中Tet3的酶活受到精密調(diào)控:在野生型小鼠中,Tet3從卵母細(xì)胞時期就開始高表達,但其功能在卵子發(fā)生過程中受到抑制,受精之后才開始發(fā)揮其氧化去甲基化的功能;而卵母細(xì)胞中LCD的缺失解除了Tet3的酶活自抑制,使小鼠卵母細(xì)胞基因組5mC發(fā)生過度氧化。進一步,研究發(fā)現(xiàn),Tet3ΔLCD突變蛋白傾向作用于原本高度甲基化的ERVK元件和母本印跡基因,且5mC高級氧化產(chǎn)物的產(chǎn)生伴隨著H3K9me3水平的降低,從而解除了對ERVK等逆轉(zhuǎn)座元件的雙重抑制,影響了ERVK附近卵子發(fā)生相關(guān)基因的表達,導(dǎo)致卵母細(xì)胞及后續(xù)胚胎發(fā)育受損。該研究揭示了位于蛋白催化活性中心的低復(fù)雜度結(jié)構(gòu)域LCD對Tet酶活的調(diào)控方式和生物學(xué)意義,拓寬了科學(xué)家對Tet酶活時空特異性調(diào)控的認(rèn)知。
 
  研究工作得到中國科學(xué)院、國家自然科學(xué)基金委員會、科學(xué)技術(shù)部等的資助,并獲得分子細(xì)胞卓越中心動物實驗技術(shù)平臺和細(xì)胞分析技術(shù)平臺的支持。
 

2024年1月9日

來源:中國科學(xué)院

 
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