白菜是世界上栽培歷史最悠久的蔬菜作物之一,是我國(guó)栽培面積最大的葉用蔬菜。作為蕓薹屬作物中第一個(gè)完成基因組測(cè)序的物種,白菜參考基因組為白菜作物的基因組研究和遺傳改良奠定重要基礎(chǔ)。但是,目前的白菜參考基因組仍然存在幾百個(gè)缺口,其10條染色體的著絲粒結(jié)構(gòu)組裝均不完整。
該團(tuán)隊(duì)利用三代測(cè)序技術(shù),獲得接近完整的白菜基因組。該基因組填補(bǔ)了白菜基因組中絕大多數(shù)缺口,完成了8條染色體從端粒到端粒的完整組裝,僅有2條染色體仍存在一個(gè)缺口;該基因組是目前組裝最為完整的白菜基因組。研究還發(fā)現(xiàn),著絲粒區(qū)域長(zhǎng)末端重復(fù)序列的平均插入時(shí)間為14萬(wàn)年,顯著晚于泛著絲粒區(qū)域,表明白菜的著絲粒區(qū)域經(jīng)歷著快速進(jìn)化。
該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程項(xiàng)目等項(xiàng)目的支持。(通訊員:陳旭)
原文鏈接:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14015
2023年2月16日
來(lái)源:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所