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中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院|珠江所在魚類種質(zhì)資源基因標(biāo)記開發(fā)方面取得新進(jìn)展

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2022-11-05  瀏覽次數(shù):71
   近日,中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所觀賞漁業(yè)研究室在魚類種質(zhì)資源基因標(biāo)記開發(fā)方面取得新進(jìn)展,相關(guān)成果以“FishPIE: A universal phylogenetically informative exon markers set for ray-finned fishes”發(fā)表于Cell旗下期刊《iScience》。

依托國(guó)家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫(kù)珠江分庫(kù)(掛靠單位中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所)保存的魚類基因資源和數(shù)據(jù)資源,從131種魚類基因組數(shù)據(jù)中篩選出直系同源基因,通過(guò)對(duì)31個(gè)目203個(gè)物種的PCR引物特異性和PCR擴(kuò)增效率進(jìn)行進(jìn)一步篩選,初步開發(fā)了82個(gè)魚類通用型核基因分子標(biāo)記(FishPIE),并構(gòu)建了魚類60個(gè)目190個(gè)科710種魚類的系統(tǒng)發(fā)育樹,得到了與使用數(shù)百個(gè)標(biāo)記的系統(tǒng)發(fā)育研究相當(dāng)?shù)姆直媛省P聵?biāo)記的開發(fā)應(yīng)用,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)魚類種質(zhì)的快速分類和鑒定,在保障準(zhǔn)確率的前提下,降低了現(xiàn)有技術(shù)耗時(shí)、費(fèi)力、成本高的問(wèn)題,同時(shí)為魚類系統(tǒng)發(fā)育提供了一種新方案,豐富了基于分子標(biāo)記對(duì)魚類系統(tǒng)發(fā)育研究的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

研究工作得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(2018YFD0900705),中國(guó)-東盟海上合作基金(CAMC-2018F))和國(guó)家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫(kù)(FGRC18537)等項(xiàng)目資助。牟希東、楊葉欣和孫金輝為共同第一作者,牟希東和中山大學(xué)馬嘉欣為共同通訊作者。

原文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004222012974

2022年10月31日

來(lái)源:中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院
 
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